按照农业部农科教发〔2011〕8号文规定，农业部重点渔场渔业资源科学观测实验站正式在本所挂牌成立，该观测站属于农业部重点实验室体系中海洋渔业与可持续发展学科群的组成部分，也是目前该学科群中唯一一个在省级研究所中挂牌的科学观测站，它是在本所渔业资源研究室和农业部东海区渔业资源与环境动态监测站浙江站的基础上成立的。
该站成立后，将由浙江省海洋水产研究所为依托单位组织运行，主要任务包括：收集群众渔业海洋捕捞基础信息和跟踪调查资料，科学合理布局渔业资源与生态野外监测点，建立海洋渔业资源与环境信息数据库；开展重要渔场及其邻近海域渔业资源与环境监测调查、渔业资源增殖放流和生态修复效果评价、生物多样性及种质资源保护等方面的研究；就渔业资源利用状况及合理利用提出资源动态综合分析报告，为调整和健全渔业管理措施和合理安排渔场生产及国际渔业谈判提供服务。