本所船舶设计研究室是浙江省船舶设计行列中成立较早、承接部省级科研设计项目较多、具有较强的渔业捕捞船、运输船、工程船、交通艇、休闲仿古船设计能力和有丰富的实船改装设计经验的一家设计实体。曾先后获得研究设计成果奖14项，其中全国科技大会奖两项、国家部级奖两项、省级奖两项。现有船体、轮机、电气、渔具专业高级工程师、工程师、助理工程师14人。设计设施齐全。近年来设计研究室改装设计的远洋鱿钓、金枪鱼渔船占到全省总量的2/3以上。设计的国内捕捞、冰鲜渔船布置合理、结构坚固、作业方便、抗风浪能力强。设计的油船、工程船、交通艇外形美观、操作方便、稳性安全。设计的休闲仿古船—舟山“绿眉毛”名扬海内外，是目前中国最大的古木帆船，设计的仿古船—北京中华郑和宝船制成船模被中国历史博物馆珍藏。