实验室围绕浙江省海洋渔业资源、浙江水域生态环境与碳汇渔业等关键共性技术问题，开展科学观测和科学实验研究。学科方向主要有渔业资源调查、增殖放流保护、渔业生态环境监测海洋牧场与生态修复等，各个专业方向的人才、科研经费等科技资源配置合理。
实验室成立以来实验站在重点学科和交叉学科的建设上取得显著进展，先后承担农业科研专项“东海渔业资源评价和增殖养护技术研究与示范”、国家海洋局海域海岸带整治修复项目“杭州湾北岸沿岸海域漂浮及海底垃圾清理(二期）”、省基金项目“基于碳、氮稳定同位素分析探讨马尾藻海藻场的食物网结构”、“东海区舌鳎科鱼类的分类与分子系统学研究”、浙江省科技厅项目“浙江省岛礁海域藻场生态修复技术研究与示范”、“浙江沿岸渔业资源增殖放流技术成果应用与转化”、浙江省海洋与渔业局项目大黄鱼、曼氏无针乌贼产卵场调查及划定”、“浙江渔场主要渔业资源动态监测调查”、“浙江省海洋渔业资源增殖放流效果调查与评估”、社会服务项目“丽水36-1气田开发项目渔业生态修复实施项目服务”、“宁波-舟山港衢山港区鼠浪湖矿石中转码头工程项目渔业生态修复实施项目技术服务合同”等三十余项科研项目，总经费2000万元以上。
先后获各级各类奖励十余项项，其中，省部级奖6项。作为参加单位完成的“东海区重要渔业资源可持续利用关键技术研究与示范”成果2014年获得国家科技进步二等奖。